MTs Qudsiyyah Putri ini berada di bawah pengawasan Kantor Kementerian Agama Kabupaten Kudus. Sistem pendidikan yang dianut adalah sistem pendidikan yang menggunakan Kurikulum 2013 serta dipadukan dengan kurikulum keagamaan dan pondok pesantren.Hasil penelitian menunjukkan bahwa bentuk kecerdasan spiritual dan akhlakul karimah santri di Pondok Pesantren Qudsiyyah Putri Kudus tergambar pada lima sikap yaitu: ikhlas, sabar, tawakkal. Tawadhu' dan percaya diri.
Pesantren Qudsiyyah Kudus. Pendidikan di Pesantren Qudsiyyah Kudus. Program Kitab Kuning; Pendidikan Formal di Ponpes Qudsiyyah; Kegiatan Santri Putra dan Putri. Ekstrakurikuler Pondok Pesantren; Pendaftaran dan Syarat; Rincian Biaya Masuk Qudsiyyah Kudus. Alamat Lengkap
Organisasi Pondok Pesantren Qudsiyyah Putri Kudus Pondok Pesantren Qudsiyyah Putri dikelola oleh Yayasan Pendidikan Islam Qudsiyyah Menara Kudus (YAPIQ). Adapun struktur kelembagaan Pondok Pesantren Qudsiyyah Putri adalah sebagai berikut: Pelindung : Ketua YAPIQ (Yayasan Pendidikan Islam Qudsiyyah) Penasehat : KH. Nur Halim Ma'ruf KH.Pondok Pesantren Qudsiyyah Putri adakan babak final Duta Santri 2022 yang bertempat di lapangan pesantren.
Metode yang digunakan dalam program unggulan tahfidz Al-Qur'an di Pondok pesantren Qudsiyyah putri yaitu Metode wahdah, metode bi-nazar, metode talaqqi, Program Tahfidz Qur'an di ponpes Qudsiyah Putri Kudus di dukung oleh fasilitas yang memadai, yaitu ruang kelas dan kamar, mushola, tersedianya kitab Al-Qur'an yang memadai baik santri membawa se
